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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
18/10/2007 |
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Data da última atualização: |
10/08/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
IBELLI, A. M. G.; ANDRÉO, R.; COUTINHO, L. L.; GOUVEIA, J. J. S.; NAKATA, L. C.; OLIVEIRA, M. C. de S.; SOUZA, J. R. T.; ZAROS, L. G.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
ADRIANA MÉRCIA G. IBELLI, UFSCar/SÃO CARLOS, SP.; R. Andréo, ESALQ/USP/PIRACICABA,SP.; LUIZ L. COUTINHO, ESALQ/USP/PIRACICABA,SP.; J. J. S. Gouveia, UFSCar/SÃO CARLOS, SP.; L. C. Nakata, ESALQ/USP/PIRACICABA, SP.; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; J. R. T. Souza, UNICEP/SÃO CARLOS, SP.; L. G. Zaros, CENTEC; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Seleção de genes constitutivos para estudos de expressão gênica em abomaso e linfonodo abomasal de bovinos |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2007. |
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Páginas: |
p. 151 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A quantificação de RNA mensageiro é amplamente utilizada em estudos de expressão gênica. O método de reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR) em tempo real é um dos mais sensíveis e eficientes para examinar os padrões de expressão. Para que se tenha uma análise confiável, a escolha de genes constitutivos estáveis é essencial. Estes genes devem apresentar expressão constante, independentemente do tecido ou tratamento utilizado. Isto permite a normalização de diferenças existentes na quantidade inicial de RNA, em possíveis variações experimentais e na síntese de cDNA. Diversos genes como GAPDH, RNA ribossômico 18S e actinas são empregados, porém variações já foram observadas, sugerindo que nenhum gene possa ser considerado estável para todas as condições experimentais. O objetivo deste trabalho foi selecionar um gene constitutivo estável em abomaso e linfonodo abomasal de bovinos. Dez bezerros da raça Nelore foram mantidos livres de infecções por parasitos desde o nascimento. Esses animais foram separados em dois grupos: 5 animais submetidos a infecção artificial com larvas de Haemonchus spp (grupo tratamento) e 5 animais livres de infecção (grupo controle). A coleta de amostras de tecidos e linfonodos abomasais foi feita sete dias após a infecção. O isolamento do RNA total foi feito com reagente Trizol (Invitrogen) e síntese de cDNA por transcrição reversa. A quantificação dos genes RPL-19, GAPDH e HPRT-1 foi avaliada pela técnica de RT-PCR em tempo real utilizando SYBR Green como corante. As análises referentes às quantificações foram realizadas com os valores de Ct obtidos para cada gene. A fim de verificar possíveis variações entre os genes, foram utilizados os programas Analyse-it (Excel), o teste não paramétrico Randomisation test e o programa de normalização Genorm. Os resultados mostraram que para linfonodo abomasal os genes RPL-19 e GAPDH não apresentaram expressão diferencial entre os tratamentos (p>0,05), enquanto que HPRT-1 foi diferencialmente expresso (p<0,05) no teste não paramétrico Randomisation test. Entre os genes RPL-19 e GAPDH os valores de desvio e erro padrão foram 1,23, 0,39 e 2,24 e 0,71, respectivamente. Para abomaso, não houve diferença significativa entre os grupos experimentais para nenhum dos três genes analisados e o gene RPL-19 apresentou o menor desvio e erro padrão (2,34 e 0,74, respectivamente). A análise realizada pelo programa Genorm mostrou que para ambos os tecidos, o gene RPL-19 foi o mais estável entre os três. Desta maneira, o gene RPL-19 foi o que mostrou maior estabilidade entre os genes analisados, podendo ser empregado em estudos de expressão gênica com tecidos e linfonodos abomasais de bovinos. MenosA quantificação de RNA mensageiro é amplamente utilizada em estudos de expressão gênica. O método de reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR) em tempo real é um dos mais sensíveis e eficientes para examinar os padrões de expressão. Para que se tenha uma análise confiável, a escolha de genes constitutivos estáveis é essencial. Estes genes devem apresentar expressão constante, independentemente do tecido ou tratamento utilizado. Isto permite a normalização de diferenças existentes na quantidade inicial de RNA, em possíveis variações experimentais e na síntese de cDNA. Diversos genes como GAPDH, RNA ribossômico 18S e actinas são empregados, porém variações já foram observadas, sugerindo que nenhum gene possa ser considerado estável para todas as condições experimentais. O objetivo deste trabalho foi selecionar um gene constitutivo estável em abomaso e linfonodo abomasal de bovinos. Dez bezerros da raça Nelore foram mantidos livres de infecções por parasitos desde o nascimento. Esses animais foram separados em dois grupos: 5 animais submetidos a infecção artificial com larvas de Haemonchus spp (grupo tratamento) e 5 animais livres de infecção (grupo controle). A coleta de amostras de tecidos e linfonodos abomasais foi feita sete dias após a infecção. O isolamento do RNA total foi feito com reagente Trizol (Invitrogen) e síntese de cDNA por transcrição reversa. A quantificação dos genes RPL-19, GAPDH e HPRT-1 foi avaliada pela técnica de RT-PCR em tempo real utilizando ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bovinos; Gene constitutivo; RPL-19; RT-PCR em tempo real. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/39628/1/PROCILCAR2007.00178.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| 1. |  | SOLAR, R. R. C.; CHAUL, J. C. M.; MAUES, M.; SCHOEREDER, J. H. A quantitative baseline of ants and orchid bees in human-modified Amazonian landscapes in Paragominas, Pará, Brazil. Sociobiology, v. 63, n. 3, p. 925-940, Sep. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|    |
| 2. | | SOLAR, R. R. de C.; BARLOW, J.; ANDERSEN, A. N.; SCHOEREDER, J. H.; BERENGUER, E.; FERREIRA, J. N.; GARDNER, T. A. Biodiversity consequences of land-use change and forest disturbance in the Amazon: A multi-scale assessment using ant communities. Biological Conservation, v. 197, p. 98-107, May 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | SOLAR, R.; BARLOW, J.; FERREIRA, J.; BERENGUER, E.; LEES, A.; LOUZADA, J.; MAUES, M.; MOURA, N.; OLIVEIRA, V.; CHAUL, J.; RIBAS, C.; SCHOEREDER, J. H.; MAC NALLY, R.; THOMSON, J. R.; VIEIRA, I. C. G.; GARDNER, T. How pervasive is biotic homogenization in human-modified tropical forests? In: INTERNATIONAL CONGRESS FOR CONSERVATION BIOLOGY, 27.; EUROPEAN CONGRESS FOR CONSERVATION BIOLOGY, 4., 2015, Montpellier. Mission biodiversity: choosing new paths for conservation: abstract book. [S.l.]: Society for Conservation Biology, 2015. p. 658-659.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | SOLAR, R. R. de C.; BARLOW, J.; FERREIRA, J.; BERENGUER, E.; LEES, A. C.; THOMSON, J. R.; LOUZADA, J.; MAUES, M.; MOURA, N. G.; OLIVEIRA, V. H. F.; CHAUL, J. C. M.; SCHOEREDER, J. H.; VIEIRA, I. C. G.; NALLY, R. M.; GARDNER, T. A. How pervasive is biotic homogenization in human-modified tropical forest landscapes? Ecology Letters, v. 18, n. 10, p. 1108-1118, Oct. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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